Loading...
Митохондрийн баркод ашиглан туузан хорхойн халдварын тархалтыг тогтоосон үр дүн
Зохиогч
Он
2022 оны дөрөвдүгээр сарын 28
Төрөл
journal article
Journal
Эрүүл мэндийн шинжлэх ухаан
Volume
18
Issue
1
Start Page
96
End Page
100
ISSN
2959-6947
Хураангуй
Митохондрийн дезоксирибонуклейн хүчлийн дарааллыг филогенетикийн шинжилгээ болон ангилал зүйд төрөл зүйлийг тодорхойлоход түгээмэл ашигладаг. Митохондрийн геном дахь цитохром С оксидазын дэд нэгж 1 (сох1) генийг баркод болгон ашиглахыг эрдэмтэд санал болгож байна. Митохондрийн геномын сох1 генийг ДНХийн баркод болгон ашиглах болсон нь бусад генүүдтэй харьцуулахад универсал праймерууд болон илүү филогенетикийн мэдээлэл агуулдаг учраас хамгийн тохиромжтой гэж үздэг. Иймд нохойн популяцид орчих туузан хорхойн халдварлалтыг митохондрийн сох1 генийн ДНХ-ийн баркод болгон ашиглан тодорхойлох зорилгоор энэхүү судалгааг хийж гүйцэтгэлээ. Нэг агшингийн тохиолдлын сонголтоор Монгол орны 21 аймгаас нийт 1242 ялгадсыг цуглуулав. Нохойны ялгадаснаас ДНХ–ийг ялгахдаа ялгадаснаас ДНХ ялгах цомог (Stool kit; - Qiagen, Germany) -ийг ашиглан үйлдвэрлэгчийн зааврын дагуу ялган цэвэршүүлэн сангерийн аргаар нуклеотидын дарааллыг тогтоосон. Судалгаанд хамрагдсан нийт дээжүүдийн cox1, 12S rRNA генийн нуклеотидийн дарааллыг тогтоон Genbank-нд хадгалагдаж буй жишиг дараалалтай харьцуулан судлахад 5.2% (64/1242)-д Taenia multiceps-ийн халдвар илэрсэн. T. multiceps-ийн халдварын тархалтыг байгалийн бүс бүслүүрээр авч үзвэл тайга (12.5%), ойт хээр (6.6%), хээр (4.7%), цөлөрхөг хээр (3.4%), цөлийн (2.3%) бүсэд тус тус илрэв. T. multiceps халдварын хамгийн өндөр хувь Хөвсгөл аймагт 13.2% (7/53) тодорхойлогдлоо. T. multiceps болон T. hydatigena зүйлүүдийн хооронд генетик зай харьцангуй хол буюу 1.140-1.168; T. hydatigena-ийн AB792722 гаплотип нь Т. hydatigena-н AB792721, AB792724 гаплотипүүдтэй генетик зай харьцангуй ойр буюу 0.002 байна.
Background: Mitochondrial deoxyribonucleic acid sequences are widely used in phylogenetic analysis and taxonomy for species identification. Scientists suggest using the cytochrome c-oxidase subunit 1 (cox1) gene in the mitochondrial genome as a barcode. The use of the mitochondrial genome gene cox1 as a DNA barcode is considered optimal because it contains universal primers and more phylogenetic information than other genes. Aim: Therefore, this study was performed to determine the presence of tapeworm infection in a dog population using the mitochondrial cox1 gene DNA barcode. Materials and Methods: A total of 1242 feces were collected from 21 provinces of Mongolia by random instant selection. Genomic DNAs from fecal samples were prepared using QIAamp DNA Stool Mini kit (Qiagen, Tokto, Japan). The mitochondrial 12S ribosomal RNA genes (12S rRNA) and cytochrome c oxidase subunit I (cox1) were amplified using primers as described. Template DNA samples were prepared using DyeTerminator Cycle Sequencing kit and all amplicons were sequenced in both directions on a 3100-Advant Genetic Analyzer. Results: Taenia multiceps infection was detected in 5.2% (64/1242) of the cox1 and 12S rRNA gene nucleotide sequences from total samples analyzed with the sequence stored in Genbank. The prevalence of Taenia multiceps infection in the natural zone was found in the taiga (12.5%), forest-steppe (6.6%), steppe (4.7%), desert steppe (3.4%), and desert (2.3%). The highest frequency of Taenia multiceps infestation was 13.2% (7/53) in Khuvsgul province. The genetic distance between Taenia multiceps and T. hydatigena species is relatively large, 1.140-1.168; the haplotype AB792722 of Taenia multiceps is genetic distance with haplotypes AB792721 and AB792724 is relatively close, 0.002. Conclusion: Our study showed that there is a high prevalence of infection with cyclophyllid cestodes in sheepdogs throughout Mongolia. Therefore, implementation of a comprehensive surveillance program, including evaluation of sheepdogs and their owners and wild animals in all ecological zones should be considered.
Нэмэлт мэдээлэл
Бүрэн эх: https://journal.mnums.edu.mn/index.php/emsu/article/view/550
Эшлэл
Ж.Тэмүүжин, Ө.Баярсайхан, Г.Өлзийжаргал, Ж.Хулан, Б.Очирхуяг, М.Наранхажид. Митохондрийн баркод ашиглан туузан хорхойн халдварын тархалтыг тогтоосон үр дүн. Эрүүл мэндийн шинжлэх ухаан. 2022;18(1):96-100.