Loading...
Монгол улсад хэрэглэж буй КОВИД-19 халдварыг илрүүлэх БХ-ПГУ цомог оношлууруудыг харьцуулан судалсан дүн
Зохиогч
Он
2022 оны арван нэгдүгээр сарын 2
Төрөл
journal article
Journal
Эрүүл мэндийн шинжлэх ухаан
Volume
18
Issue
6
Start Page
55
End Page
61
ISSN
2959-6947
Хураангуй
Үндэслэл: Дэлхийн зах зээл дээр ойролцоогоор 380 орчим цомог SARS CoV2 оношлуур худалдаалагдаж байгаагаас манай оронд Хятад, Орос, Коронавирус Герман, АНУ, Солонгос зэрэг улс орнууд болон дотоодод үйлдвэрлэсэн Томуу оношлуурыг Ковид-19-ийн халдварыг илрүүлэх шинжилгээнд ашиглаж Томуу төст өвчин байна. Одоогоор манай улсын зах зээл дээр байгаа Ковид-19-ийн халдварыг илрүүлэх бх-ПГУ-ын оношлуурын өвөрмөц болон мэдрэг чанарыг үнэлсэн судалгаа цөөн байгаа юм. Зорилго: Манай улсад хэрэглэгдэж буй бх-ПГУ-ын цомог оношлуурын өвөрмөц, мэдрэг чанарыг үнэлэх. Арга, аргачлал: Энэхүү судалгаанд Манай улсад хэрэглэж буй SARS-CoV-2 вирусийн халдварыг илрүүлэх 7 төрлийн бх-ПГУ-ын оношлуур болон Халдварт Өвчин Судлалын Үндэсний Төв (ХӨСҮТ)-д Ковид-19-ийн халдвар илрүүлэх нийт 94 сорьцыг уг судалгаанд хамруулав. Мөн уг оношлууруудын SARS-CoV-2 вирусийн РНХ-ийн агууламжаас хамааралтай илрүүлэлтийг судлахын тулд батлагдаад 1-2 хонож буй өвчтөнөөс хамар залгиурын арчдас цуглуулан 2 мл 0.9%-ийн NaCl-ын уусмалд SARS-CoV-2 вирусийн концентраци өндөртэй дээж (stock solution) бэлтгэж, тухайн дээжээ дараалан шингэрүүлгийн аргаар шингэрүүлэв. Шингэрүүлэлт тус бүрийг бх-ПГУ-ын аргаар шинжилж Ct утгыг тогтоов. Үр дүн: Судалгаанд SARS-CoV-2 илрүүлэх Seegene “AllplexTM SARS-CoV-2 Assay” (Seegene), XABT “Multiple Real-Time PCR Kit for Detection of 2019-CoV” (Xabt), WANTAI “SARS-CoV-2 RTPCR Kit” (Wantai), 3D MED “ANDIS SARS-CoV-2 and influenza A/B, RTqPCR Detection Kit” (3D MED), CHOROS MNG “SARS-CoV-2 RT-qPCR” (Choros MNG), BGI “Real-time fluorescent RT-PCR kit detecting 2019nCoV” (BGI), SD Sensor “STANDART M nCoV Real-Time Detection kit” (SD Sensor) гэсэн 7 оношлуурыг ашиглав. Шинжилгээний үр дүнгээр нийт 62 “Эерэг” сорьцыг “Эерэг” илрүүлсэн 4 (57.1%) оношлуур, 61 “эерэг” илрүүлэлт бүхий 1 (14.3%); 59 “Эерэг” илрүүлэлт бүхий 1 (14.3%); 58 “Эерэг” илрүүлэлт бүхий 1 (14.3%) байв. Харин “Сөрөг” сорьцыг 32 “Сөрөг” илрүүлсэн 4 (57.1%), 30 “Сөрөг” сорьц илрүүлсэн 2 (28.6%); 28 сөрөг сорьц илрүүлсэн 1 (14.3%) оношлуур байв. Мэдрэг чанар, өвөрмөц чанарыг 2х2 хүснэгтээр үнэлэхэд Seegene, Wantai, Choros MNG, SD Sensor оношлууруудын мэдрэг чанар 100%, BGI оношлуур 98.38%, 3D MED оношлуур 95.16%, Xabt оношлуур 93.54% байлаа. Түүнчлэн өвөрмөц чанарыг тооцоолоход Xabt, Wantai, 3D MED, BGI оношлуурууд 100%, Seegene, SD Sensor оношлуурууд 93.75%, Choros MNG оношлуур 87.5% байв. Эерэг болон Сөрөг илрүүлэх магадлал (PPV, NPV)-ын хувьд Xabt, Wantai, 3D MED, BGI оношлуурууд 100% эерэг илрүүлэх магадлалтай; Seegene, Wantai, Choros MNG, SD Sensor оношлуурууд 100% сөрөг илрүүлэх магадлалтай. Дүгнэлт: Манай улсад хэрэглэгдэж буй Ковид-19-ийн халдварыг илрүүлэх бх-ПГУ-ын оношлууруудын мэдрэг чанар болон өвөрмөц чанар харилцан адилгүй байв. Тухайлбал Seegene, Wantai, Choros MNG, SD Sensor оношлуурууд мэдрэг чанар өндөртэй байсан бол Xabt, Wantai, 3D MED, BGI оношлууруудын өвөрмөц чанар өндөр байв.
Background: 380 commercial kits have been developed and commercialized worldwide. In Mongolia we use Chinese, Russian, German, American, Korean and own country’s Kits for detection of Covid -19 infection. Only few studies are done for sensitivity and specificity analysis for commercial RT-PCR kits in our country. Aim: To evaluate specificity and sensitivity of commercial RT-PCR kits currently in use in our country. Materials and Methods: Commercially available 7 SARS-CoV-2 detection RT-PCR Kits were used for comparison and 94 participants, who are referred to National Center for Communicable Disease for detection of Covid-19 infections, included. Nasopharyngeal swab collected within 1-2 days after patient diagnosis. SARS-CoV-2 stock solution was diluted in 2 mL 0.9% NaCl solution for detection of RNA dependent screening. Samples were diluted by sequential dilution technique. Each dilution sample were tested by RT-PCR assays and determined Ct values. Results: Sensitivity and specificity of 7 RT-PCR Kits (Seegene “AllplexTM SARS-CoV-2 Assay” (Seegene), XABT “Multiple Real-Time PCR Kit for Detection of 2019-CoV” (Xabt), WANTAI “SARS-CoV-2 RT-PCR Kit” (Wantai), 3D MED “ANDIS SARS-CoV-2 and influenza A/B, RT-qPCR Detection Kit” (3D MED), CHOROS MNG “SARSCoV-2 RT-qPCR” (Choros MNG), BGI “Real-time fluorescent RT-PCR kit detecting 2019-nCoV” (BGI), SD Sensor “STANDART M nCoV Real-Time Detection kit” (SD Sensor)) currently in use were used for comparison. At least 6 positive results indicates “Positive” result. At least 6 negative results indicate “negative” result. 4 Kits (57.1%) detected all positive 62 cases as positive. 1 Kit (14.3%) detected 61 cases positive. 1 kit (14.3%) detected 58 cases as positive. 4 kits (57.1%) detected all 32 negative cases as negative. 2 Kits (28.6%) detected 30 cases as negative. 1 Kit (14.3%) detected 28 cases as negative. Sensitivity and specificity using 2x2 table showed 100% sensitivity is detected in Seegene, Wantai, Choros MNG, SD Sensor Kits, 98.38% in BGI Kit, 98.13% in 3D MED Kit, 93.54% in Xabt kit respectively. While high 100% specificity is detected in Xabt, Wantai, 3D MED, BGI Kits, 93.75% in Seegene, SD Sensor, 87.5% in Chorus MNG Kit. According to the negative and positive predictive value analysis Xabt, Wantai, 3D MED, BGI had 100% PPV, Seegene, Wantai, Choros MNG, SD Sensor Kits had 100% NPV. Conclusion: The sensitivity and specificity of the RT-PCR tests used in our country for the detection of COVID-19 infection differed. Seegene, Wantai, Choros MNG, and SD Sensor had high sensitivity, while Xabt, Wantai, 3D MED, and BGI had high specificity.
Нэмэлт мэдээлэл
Бүрэн эх: https://journal.mnums.edu.mn/index.php/emsu/article/view/736
Эшлэл
Э.Цолмончимэг, Г.Цогзолмаа, Ц.Наранзул, Ч.Бат-Оюун, С.Анхбаяр, Б.Мөнхцэцэг. Монгол улсад хэрэглэж буй КОВИД-19 халдварыг илрүүлэх БХ-ПГУ цомог оношлууруудыг харьцуулан судалсан дүн. Эрүүл мэндийн шинжлэх ухаан. 2022;18(6):55-61.